بر اساس دستور العمل ماده 20 قانون پایانه های فروشگاهی و سامانه مودیان که در اواسط خرداد ماه از سوی وزیر اقتصاد ابلاغ شده است، مودیانی که تمام تکالیف مقرر در قانون را رعایت نموده و از نرم افزار حسابداری مورد تایید کارگروه راهبری سامانه مودیان اشخاص موضوع بند ج ماده قانون پایانه های فروشگاهی و سامانه مودیان مصوب سال 1398 مجلس استفاده می کنند، از ارائه دفاتر یا اسناد و مدارک موضوع قوانین مالیاتهای مستقیم و مالیات ارزش افزوده مستثنی هستند.
در صورت عدم استفاده از نرم افزار حسابداری مودی مکلف به ارائه اسناد و مدارک موضوع قوانین مالیات های مستقیم و مالیات ارزش افزوده خواهد بود.
و بر اساس ماده 2 دستورالعمل موضوع ماده 20 قانون پایانه های فروشگاهی و سامانه مودیان، مودیانی که تمامی تکالیف مقرر در قانون را به شرح زیر رعایت نموده و از نرم افزار حسابداری استفاده میکنند، از ارائه دفاتر یا اسناد و مدارک موضوع قوانین مالیات های مستقیم و مالیات بر ارزش افزوده مستثنی میباشند.
در ماده 3 همین دستور العمل آمده است، در صورت عدم استفاده از نرم افزار حسابداری یا عدم رعایت تمام یا بخشی از تکالیف مقرر درماده 2 این دستورالعمل، مودی مکلف به ارایه دفاتر و اسناد و مدارک موضوع قوانین مالیات های مستقیم و مالیات بر ارزش افزوده حسب مورد طبق مقررات مربوط میباشد.
همچنین در ماده 5 این دستورالعمل آمده است، مودی مجاز است در طی سال مالی با رعایت ضوابط اعلامی توسط سازمان، نرم افزار حسابداری قبلی خود را با نرم افزار حسابداری جدید جایگزین نماید.
در ماده 6 آمده، مودیانی که از نرم افزار حسابداری استفاده می نمایند، در خصوص اسناد و مدارک تولید شده در نرم افزار حسابداری و همچنین ثبت شده در سامانه مودیان، در صورت رعایت مفاد این دستورالعمل، الزامی به ارائه مجدد آنها بصورت غیر الکترونیکی برای بهره مندی از مشوق ها، معافیت ها، نرخ صفر و تسهیلات مقرر در قوانین پایانه های فروشگاهی و سامانه مودیان، مالیات های مستقیم و مالیات بر ارزش افزوده با رعایت مقررات مربوط حسب مورد نخواهند داشت.